隨著科技的飛速發展，生命科學已經成為一個跨學科融合的前沿領域。然而，這一領域的工具和資源一直面臨著標準化和規范化的挑戰。Bio-OS平臺的出現，不僅為科研人員提供了一個高效、便捷、可復現的分析環境，還為學生和新入行者提供了學習和實踐的平臺，極大地推動了生命科學的發展和教育。

為了進一步推動國內生命科學領域的交流與合作，構建一個“開放、創新、合作、共贏”的科研新生態，CCF開源創新大賽暨第二屆Bio-OS開源開放大賽于近日盛大啟動。為了深入了解Bio-OS平臺的價值和影響，51CTO采訪了本屆大賽的主席、大賽的合作方、往屆參賽團隊的指導老師以及參賽選手，分享了他們對Bio-OS平臺的獨到見解和深刻認識，以及他們在參賽過程中的寶貴經驗，為我們揭示了Bio-OS 這一平臺在推動生命科學發展中所扮演的重要角色。

Bio-OS應運而生，賦能科研新時代

長久以來，生物信息學領域呈現出了多樣化的數據庫、分析工具、開源算法庫、軟件包和軟件支撐系統，這些資源來自各個研究機構和企業，它們在不同領域內獨立開發，以支持生物信息學分析系統的構建與部署。然而，由于缺乏統一的標準和規范，這些工具往往各自為政，難以形成統一的研發范式，也無法廣泛成為生物信息技術和大數據處理的有力支撐體系。

隨著生物信息學不斷融入人工智能、大數據等前沿技術，其跨學科特性愈發顯著。在這一背景下，Bio-OS平臺的應運而生誕生。正如本屆大賽主席，廣州實驗室研究員，博士生導師，科學數據平臺主任李亦學所強調的，面對大數據時代數據密集型科研第四范式和AI4Science第五范式所帶來的科研挑戰，廣州實驗室與火山引擎攜手打造了Bio-OS平臺，提供了標準化、規范化的生物信息學分析工具和環境，以應對生信領域的變革。

Bio-OS平臺不僅顯著降低了生物醫學大數據挖掘的復雜度，還能靈活便捷地構建符合研究任務需求的大數據分析工作流。其結果的可復現性使得研究人員能夠更專注于本領域的科學問題，從而加速科學發現并提高研究效率。對于高校學子而言，Bio-OS平臺同樣提供了豐富的實踐機會，他們可以通過平臺靈活設置實踐課程，進行基礎的生物信息學學習和訓練，迅速成長為生物信息學領域的技術專家和能手，為科研事業貢獻更多力量。

廣州金域基因檢測中心生物信息部主任孫明明認為，Bio-OS平臺是一種全新的模式，它不僅提供了數據分享的功能，還集成了眾多先進工具。這一平臺將生物信息學與云平臺緊密結合，使學習者和研究者能夠更方便地分享數據和工具，不再受限于自己的科研院所或公司。這種開放性不僅拓寬了整個生物信息產業鏈的視野，也為生物信息學領域的創新和發展注入了新的活力。

作為此次大賽的合作方，尋因生物在數據資源和技術方面提供相應的支持。除了對大賽的支持以外，尋因生物也正在將部分業務遷移到Bio-OS平臺。尋因生物生信總監張廣鑫也非常認同Bio-OS平臺的設計理念。“Bio-OS是一個開放的平臺，用戶可以共享分析的軟件、環境和代碼，同時提供公有的數據集供用戶使用，還可以方便得調用私有的數據，并且保護數據安全。Bio-OS平臺可以幫助用戶提升分析效率，減少計算資源和計算環境的關注，將更多時間和精力集中在生物特征和生物現象本身。并且Bio-OS平臺底座是在火山引擎上，公有云的方式也減少了我們對計算資源焦慮的痛苦。”

Bio-OS驅動多領域生命科學價值創新

隨著生命科學領域的飛速發展，對高效、可靠、可復現的分析平臺的需求日益迫切。Bio-OS平臺不僅滿足了這些核心需求，更為多個領域帶來了前所未有的價值。無論是提升科研效率、推動學術交流，還是助力人才培養，Bio-OS平臺都展現出了其獨特的魅力和深遠的影響力。

據了解，Bio-OS平臺以其云原生架構體系和GA4GH規范標準的支持，展現了其在生命科學領域的獨特優勢。這一平臺不僅確保了分析流程的可移植性，還踐行了“一次構建，處處運行”的云原生理念，使得生命科學領域的研究人員能夠輕松一鍵開啟生物信息學分析，大大提高了科研效率。

西安電子科技大學計算機科學與技術專業計算生物信息學研究所研三學生黃朝陽指出，生信論文復現環節常常面臨多重挑戰，任何一個環節的失誤都可能導致無法復現的結果。然而，Bio-OS平臺通過打包整個實驗流程，極大地簡化了這一流程。研究人員無需自行配置代碼搭建環境，只需登錄Bio-OS平臺，一鍵運行，上傳數據，符合規范后即可迅速獲得分析結果。這種便捷性大大降低了論文復現的門檻，為科研工作者帶來了極大的便利。

對于高校和科研機構而言，Bio-OS平臺是一個實踐平臺，可幫助學生和研究者更好地培養數據思維、掌握必要的技術和分析思路。成都東軟學院健康醫療科技學院杜萌澤老師強調，數據在生物信息學中占據著舉足輕重的地位。過去，科研數據多來源于已發表的文章，這些數據通常存放在公共數據庫中，且對數據輸出的限制較多。但Bio-OS平臺，可讓數據獲取以及后續復現環境搭建變得更加簡單，從而也提高了數據的可復現性。通過平臺上的實時交互分析環境和數據管理工具，學生可以更快地掌握生物信息學的基本知識和技能，為未來的科研創新打下堅實的基礎。

上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院主治醫師、Hiplot平臺創始人兼首席技術顧問王銘杰對Bio-OS平臺給予了高度評價。他認為Bio-OS不僅是一個超前的理念，更是未來生物信息學發展的長遠著眼點。他表示，Bio-OS的設計理念與國際一流的生物信息云平臺保持一致，以Workspace為核心理念構建生信分析工作環境，并在工具、技術標準、數據管理、任務執行與調度等方面實現了規范統一。這一平臺的出現有望促進不同醫院和研究所之間的數據和技術交流，進一步弱化壁壘，推動整個生物信息學領域的發展。

Bio-OS平臺無疑為生命科學領域注入了新的活力。它不僅以其高效、便捷的特性，讓科研工作者們能夠更輕松地應對挑戰，更以其開放、共享的精神，促進了不同領域間的交流與合作。

Bio-OS開源開放大賽開啟，精英經驗分享

Bio-OS開源開放大賽是面向生物醫學領域相關高校、科研機構、企業等從業人員的全國性公益大賽。2023年，首屆大賽就吸引了來自全球45所高校、16所科研機構、8家企業接近200支團隊、400多名選手參與。經過一個多月的激烈角逐、層層選拔，最終25支參賽團隊榮獲大賽各個獎項。

2024年，CCF開源創新大賽暨第二屆Bio-OS開源開放大賽也于近日正式開賽。本屆大賽更是在中國計算機學會和廣州實驗室的聯合指導下，由火山引擎和 Intel 聯合主辦，協辦單位包括中國生物信息學學會（籌）、中國計算機學會開源發展委員會、上海生物信息學會、廣東省生物信息學會，公益支持單位為中國光華科技基金。本屆大賽的賽題分為三個賽道，包括論文復現賽道、任務挑戰賽道和AI賽道，三個賽道獎金總額達到31.5萬元，并且邀請到業內知名專家和學者作為大賽評委團。

作為第一屆大賽論文復現賽道的前三強，黃朝陽分享了他的寶貴經驗。他強調，在配置基礎環境時，務必先運行主要示例代碼，隨后再逐步完善輔助環境和輔助代碼的運行。他建議參賽者不要一次性將最終環境全部部署到Bio-OS平臺，而應逐步更新，以防止因環境問題導致的代碼運行失敗。

作為第一屆大賽任務挑戰賽前三強的孫明明則建議參賽者注重積累和實踐。他認為，只有不斷學習、練習和沉淀知識，才能在比賽中游刃有余。他特別指出，對Bio-OS系統的熟悉程度將直接影響參賽的難度，因此前期的準備和了解至關重要。

而同樣作為第一屆大賽任務挑戰賽前三強的王銘杰則特別強調了團隊合作的重要性。他建議參賽者不要孤軍奮戰，而是組建一個分工明確、具備綜合生物信息和IT知識的團隊。他認為，團隊合作能夠更有效地解決賽題，提高完成質量，從而更容易取得好成績。同時，他也提醒參賽者，由于比賽高手云集，必須全力以赴，不可掉以輕心。

值得一提的是，在第一屆大賽中，成都東軟學院派出了15支參賽隊伍，共計50多位才華橫溢的同學。他們在論文復現賽道上憑借出色的表現，榮獲了第二名的好成績。作為成都東軟學院參賽團隊的指導老師，杜萌澤鼓勵學生們以積極的心態面對比賽。她認為，參與比賽本身就是一次寶貴的學習和成長機會，無論結果如何，過程中的收獲都是巨大的。她鼓勵學生們“但做好事，莫問前程”，勇于嘗試，不斷努力，為生物信息學領域的發展貢獻自己的力量。

共赴生命科學盛宴，探索創新之路

CCF開源創新大賽暨第二屆Bio-OS開源開放大賽不僅是生命科學領域的一次盛會，更是推動行業發展、促進學術交流的重要平臺。目前，大賽已經開啟報名，并且進入到初賽階段。我們誠摯邀請對生命科學領域充滿熱情的師生、研究人員和行業專家參與其中，共同探索生命科學的無限可能。

報名連接：https://www.bagevent.com/event/registerTicket/8826248

報名二維碼：

小助手二維碼：

大賽組織：

1. 指導單位：中國計算機學會、廣州實驗室
2. 主辦單位：火山引擎、Intel
3. 協辦單位：中國計算機學會開源發展委員會、中國生物信息學學會（籌）、上海生物信息學會、廣東省生物信息學會
4. 公益支持單位：中國光華科技基金會
5. 合作單位：尋因生物、南方醫科大學、成都東軟學院
6. 合作伙伴：字節跳動開源、稀土掘金、火山開發者社區、字節跳動技術團隊、DeepTech、51CTO、YuLabSMU、生信石頭、優雅R、生信媛、小麥研究聯盟、悟空平臺omics、多組學與健康、生信技能樹、宏基因組、生信基地biomamba