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使用上下文裝飾器調試Pytorch的內存泄漏問題

開發 前端
裝飾器是 python 上下文管理器的特定實現。本片文章將通過一個pytorch GPU 調試的示例來說明如何使用它們。雖然它可能不適用于所有情況,但我它們卻是非常有用。

裝飾器是 python 上下文管理器的特定實現。本片文章將通過一個pytorch  GPU 調試的示例來說明如何使用它們。雖然它可能不適用于所有情況,但我它們卻是非常有用。

圖片

調試內存泄漏問題

有很多方法可以調試內存泄漏。本文將展示一種識別代碼中有問題的行的有用方法。該方法可以有助于以簡潔的方式找到具體的位置。

逐行手動調試

如果遇到問題,一種經典的且常用的方法是使用調試器逐行檢查,比如下面的例子:

  • 在搜索引擎查找有關如何計算 pytorch 中所有張量總數的代碼片段,比如:tensor-counter-snippet
  • 在代碼中設置斷點
  • 使用tensor-counter-snippet來獲得張量的總數統計
  • 使用調試器執行下一步操作
  • 重新運行 tensor-counter-snippet,并檢查張量計數是否增加
  • 重復上面的步驟

它可以工作,但這樣的操作光聽起來來就很麻煩。我們可以將其封裝成一個函數,這樣可以在需要的時候調用,這樣幾乎不需要修改現有的代碼,所以就引出了我們要介紹裝飾器的功能。

Python 裝飾器

裝飾器可以包裝在代碼的任意部分。這里我們通過裝飾器來完成檢查是否有額外的張量 ,除此以外我們還需要一個計數器,因為需要在執行之前和之后計算張量的數量。該模式如下所示:

def memleak_wrapper(func):
def wrap(*args, **kwargs):
print("num tensors start is ...")
out = func(*args, **kwargs)
print("num tensors end is ...")
return out
return wrap@memleak_wrapper
def function_to_debug(x):
print(f"put line(s) of code here. Input is {x}")
out = x + 10
return outout = function_to_debug(x=1000)
print(f"out is {out}")

#輸入類似這樣
#num tensors start is ...
#put line(s) of code here. Input is 1000
#num tensors end is ...
#outis 1010

要運行這個代碼,我們就需要將要檢查的代碼行放入函數 (function_to_debug)。但是這不是最好的,因為我們還需要手動插入很多代碼。另外就是如果代碼塊生成的變量多于一個,還需要尋找額外的解決方案來使用這些下游變量。

上下文裝飾器

為了解決上面問題,我們的可以使用上下文管理器來代替函數裝飾器。上下文管理器最廣泛使用的示例是使用 with 語句實例化上下文。以前最常見的就是:

with open("file") as f:

使用Python的contextlib庫,Python用戶可以輕松地自己創建上下文管理器。所以本文中我們將使用ContextDecorator完成在上面嘗試使用decorator所做的工作。因為它但更容易開發,也更容易使用:

 from contextlib import ContextDecorator

class check_memory_leak_context(ContextDecorator):
def __enter__(self):
print('Starting')
return self

def __exit__(self, *exc):
print('Finishing')
return False

ContextDecorator 有2 個方法:enter() 和 exit() ,當我們進入或退出上下文時會調用它們。__exit__ 中的 *exc 參數代表任何傳入的異常。

現在我們來使用它解決上面說的問題。

使用 ContextDecorator 找出內存泄漏

因為要計算張量的總數,所以我們將計算過程封裝成一個函數 get_n_tensors() ,這樣可以在上下文開始和結束時來計算張量數量:

class check_memory_leak_context(ContextDecorator):
def __enter__(self):
self.start = get_n_tensors()
return self def __exit__(self, *exc):
self.end = get_n_tensors()
increase = self.end self.start

if increase > 0:
print(f”num tensors increased with"\
f"{self.end self.start} !)
else:
print(”no added tensors”)
return False

如果有增加,則將其打印到控制臺。

get_n_tensor()使用垃圾收集器(gc),是為pytorch定制的,但可以很容易地修改為其他的庫:

 import gc
def get_n_tensors():
tensors= []
for obj in gc.get_objects():
try:
if (torch.is_tensor(obj) or
(hasattr(obj, ‘data’) and
torch.is_tensor(obj.data))):
tensors.append(obj)
except:
pass
return len(tensors)

現在就可以使用了,我們對任何一行(或塊)代碼使用這個上下文:

 x = arbitrary_operation(x)
...
with check_memory_leak_context():
y = x[0].permute(1, 2, 0).cpu().detach().numpy()
x = some_harmless_operation()
...
x = another_arbitrary_operation(x)

如果上下文修飾器包裝的行內創建了一個新的張量,它就會打印出來。

總結

這是一個非常好的代碼片段,你可以在開發過程中把它放在一個單獨的文件中,下面是本文的完整代碼:

https://gist.github.com/MarkTension/4783697ebd5212ba500cdd829b364338

最后希望這篇小文章能讓你了解什么是上下文管理器,如何使用上下文裝飾器,以及如何將它們應用于調試pytorch。

責任編輯:華軒 來源: DeepHub IMBA
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